Хлебопекарные продукты являются идеальным выбором для МГС, и данная технология широко используется для упаковки этих пищевых продуктов. Типичными хлебопекарными изделиями, при упаковке которых используется МГС, являются плоский кукурузный хлеб, пита, наан и прочие виды плоского хлеба. Сравнительно низкое содержание воды в этих продуктах приводит к тому, что практически единственным видом микроорганизмов, способных вызвать их порчу, являются плесневые грибки, так как бактерии предпочитают среду с более высоким содержанием воды. Плесневые грибки являются аэробными, и для роста им необходим содержащийся в воздухе кислород. Таким образом, исключение из газовой смеси кислорода и его замена высоким содержанием двуокиси углерода – до 100% – является эффективным способом значительного увеличения срока хранения этих видов хлеба. Большим преимуществом использования высокой концентрации CO2 в качестве газовой среды при упаковке является сравнительно простой процесс проверки упаковок на предмет утечек. Системы обнаружения утечек двуокиси углерода давно разработаны и прекрасно зарекомендовали себя; кроме того, их можно настраивать на автоматическую работу в процессе упаковки продуктов.

Механическая целостность упаковки имеет особое значение для хлебопекарных изделий, так как любые утечки способны привести к проникновению кислорода внутрь упаковки, что может вызывать быстрое образовании плесени и черствение продукта.

В стандартных условиях срок хранения готового хлебопекарного продукта, упакованного с использованием газовой среды исключительно из двуокиси углерода, увеличивается с 5 до приблизительно 20 дней в условиях хранения при комнатной температуре. Срок хранения некоторых продуктов при упаковке с использованием наиболее подходящей МГС и упаковочных материалов способен увеличиться до шести месяцев. Упаковка хлебопекарных изделий данным способом означает, что продукты не нужно замораживать, что, в свою очередь, делает их хранение, транспортировку и сбыт гораздо более простыми и дешевыми.

МГС также можно применять и для других хлебобулочных изделий, однако при этом необходимо учитывать ряд ограничений. При упаковке продуктов, покрытых слишком большим количеством сахарной глазури, необходимо принимать во внимание тот факт, что двуокись углерода способна вызвать ухудшение внешнего вида изделия. В этом случае небольшое количество азота в газовой смеси способно решить данную проблему.